MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sinorhizobium medicae WSM419 plasmid pSMED02

Total Repeats: 26098

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009621	GGC	2	6	11	16	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_009621	GGC	2	6	62	67	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150377169
3	NC_009621	GGC	2	6	186	191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150377169
4	NC_009621	TCG	2	6	194	199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150377169
5	NC_009621	TCG	2	6	232	237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150377169
6	NC_009621	CGC	2	6	279	284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150377169
7	NC_009621	TCT	2	6	304	309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150377169
8	NC_009621	TTC	2	6	333	338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150377169
9	NC_009621	A	7	7	360	366	100 %	0 %	0 %	0 %	150377169
10	NC_009621	GCG	2	6	409	414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150377169
11	NC_009621	CCA	2	6	486	491	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150377169
12	NC_009621	GC	3	6	497	502	0 %	0 %	50 %	50 %	150377169
13	NC_009621	TTCG	2	8	643	650	0 %	50 %	25 %	25 %	150377169
14	NC_009621	TGC	3	9	669	677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150377169
15	NC_009621	TC	3	6	715	720	0 %	50 %	0 %	50 %	150377169
16	NC_009621	GCC	2	6	854	859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150377169
17	NC_009621	ACA	2	6	884	889	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150377169
18	NC_009621	ACT	2	6	898	903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150377169
19	NC_009621	ATG	2	6	954	959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150377169
20	NC_009621	TGAG	2	8	987	994	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009621	TCCGCG	2	12	1008	1019	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
22	NC_009621	AGG	2	6	1160	1165	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150377170
23	NC_009621	TCC	2	6	1184	1189	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	150377170
24	NC_009621	CGA	2	6	1197	1202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150377170
25	NC_009621	GTA	2	6	1210	1215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150377170
26	NC_009621	CCGC	2	8	1231	1238	0 %	0 %	25 %	75 %	150377170
27	NC_009621	GCC	2	6	1351	1356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150377170
28	NC_009621	GCC	2	6	1402	1407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150377170
29	NC_009621	GGT	2	6	1422	1427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150377170
30	NC_009621	TCG	2	6	1538	1543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150377170
31	NC_009621	GCC	2	6	1622	1627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150377170
32	NC_009621	CCG	2	6	1719	1724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150377170
33	NC_009621	GCG	2	6	1852	1857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150377171
34	NC_009621	CAG	2	6	1882	1887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150377171
35	NC_009621	GGC	2	6	1957	1962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150377171
36	NC_009621	GTT	2	6	1990	1995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150377171
37	NC_009621	GGT	2	6	2020	2025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150377171
38	NC_009621	GAA	2	6	2059	2064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150377171
39	NC_009621	ATG	2	6	2078	2083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150377171
40	NC_009621	GAC	2	6	2116	2121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150377171
41	NC_009621	CGC	2	6	2145	2150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150377171
42	NC_009621	CGA	2	6	2169	2174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150377171
43	NC_009621	AGC	2	6	2183	2188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150377171
44	NC_009621	GCG	2	6	2266	2271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150377171
45	NC_009621	CTTC	2	8	2354	2361	0 %	50 %	0 %	50 %	150377171
46	NC_009621	GGC	2	6	2375	2380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150377171
47	NC_009621	GAA	2	6	2392	2397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150377171
48	NC_009621	GAA	2	6	2413	2418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150377171
49	NC_009621	CGA	2	6	2445	2450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150377171
50	NC_009621	CGC	2	6	2472	2477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150377171
51	NC_009621	AGCG	2	8	2514	2521	25 %	0 %	50 %	25 %	150377171
52	NC_009621	AT	3	6	2546	2551	50 %	50 %	0 %	0 %	150377171
53	NC_009621	CTC	2	6	2668	2673	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	150377171
54	NC_009621	GCG	2	6	2691	2696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150377171
55	NC_009621	CAT	2	6	2701	2706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150377171
56	NC_009621	CGATCG	2	12	2718	2729	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	150377171
57	NC_009621	TGG	2	6	2736	2741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150377171
58	NC_009621	GGTC	2	8	2943	2950	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NC_009621	AG	3	6	3036	3041	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009621	GCCG	2	8	3079	3086	0 %	0 %	50 %	50 %	150377172
61	NC_009621	CGA	3	9	3094	3102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150377172
62	NC_009621	TCC	2	6	3111	3116	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	150377172
63	NC_009621	GTG	2	6	3193	3198	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150377172
64	NC_009621	GAC	2	6	3200	3205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150377172
65	NC_009621	GGATG	2	10	3223	3232	20 %	20 %	60 %	0 %	150377172
66	NC_009621	CAT	2	6	3236	3241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150377172
67	NC_009621	CGGA	2	8	3327	3334	25 %	0 %	50 %	25 %	150377172
68	NC_009621	CAG	2	6	3362	3367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150377172
69	NC_009621	CGGC	2	8	3368	3375	0 %	0 %	50 %	50 %	150377172
70	NC_009621	CGT	2	6	3637	3642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150377173
71	NC_009621	CGCC	2	8	3747	3754	0 %	0 %	25 %	75 %	150377173
72	NC_009621	GC	3	6	3792	3797	0 %	0 %	50 %	50 %	150377173
73	NC_009621	GTG	2	6	3850	3855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150377173
74	NC_009621	GAT	2	6	3964	3969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150377173
75	NC_009621	CGT	2	6	4012	4017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150377173
76	NC_009621	C	6	6	4095	4100	0 %	0 %	0 %	100 %	150377174
77	NC_009621	GCA	2	6	4101	4106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150377174
78	NC_009621	AG	3	6	4121	4126	50 %	0 %	50 %	0 %	150377174
79	NC_009621	CG	3	6	4152	4157	0 %	0 %	50 %	50 %	150377174
80	NC_009621	GGC	2	6	4169	4174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150377174
81	NC_009621	CCCG	2	8	4198	4205	0 %	0 %	25 %	75 %	150377174
82	NC_009621	GCGA	2	8	4257	4264	25 %	0 %	50 %	25 %	150377174
83	NC_009621	AAG	2	6	4302	4307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150377174
84	NC_009621	CA	3	6	4497	4502	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_009621	CGG	2	6	4544	4549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_009621	CGAGG	2	10	4622	4631	20 %	0 %	60 %	20 %	150377175
87	NC_009621	GAG	2	6	4668	4673	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150377175
88	NC_009621	TGG	2	6	4733	4738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150377175
89	NC_009621	GCC	3	9	4743	4751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150377175
90	NC_009621	CCG	2	6	4772	4777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150377175
91	NC_009621	CTG	2	6	4789	4794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150377175
92	NC_009621	GCC	2	6	4836	4841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150377175
93	NC_009621	GACG	2	8	4855	4862	25 %	0 %	50 %	25 %	150377175
94	NC_009621	CCA	2	6	4914	4919	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150377175
95	NC_009621	TCG	2	6	5023	5028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150377175
96	NC_009621	CTT	2	6	5046	5051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150377175
97	NC_009621	CGG	2	6	5147	5152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150377175
98	NC_009621	GGCG	2	8	5240	5247	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
99	NC_009621	GAT	2	6	5292	5297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150377176
100	NC_009621	CCG	2	6	5309	5314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150377176
101	NC_009621	CCG	2	6	5366	5371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150377176
102	NC_009621	GC	3	6	5598	5603	0 %	0 %	50 %	50 %	150377176
103	NC_009621	GTCCA	2	10	5641	5650	20 %	20 %	20 %	40 %	150377176
104	NC_009621	TCCA	2	8	5668	5675	25 %	25 %	0 %	50 %	150377176
105	NC_009621	CTG	2	6	5725	5730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150377176
106	NC_009621	ACGC	2	8	5745	5752	25 %	0 %	25 %	50 %	150377176
107	NC_009621	GA	3	6	5796	5801	50 %	0 %	50 %	0 %	150377176
108	NC_009621	CGA	2	6	5807	5812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150377176
109	NC_009621	GCG	2	6	5818	5823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150377176
110	NC_009621	CGT	2	6	5855	5860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150377176
111	NC_009621	CAT	2	6	5867	5872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150377176
112	NC_009621	TCG	2	6	5906	5911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150377176
113	NC_009621	GGC	2	6	5969	5974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150377176
114	NC_009621	TC	3	6	5979	5984	0 %	50 %	0 %	50 %	150377176
115	NC_009621	CCA	2	6	5988	5993	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150377176
116	NC_009621	C	6	6	6010	6015	0 %	0 %	0 %	100 %	150377176
117	NC_009621	ATG	2	6	6016	6021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150377176
118	NC_009621	CGA	2	6	6047	6052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150377176
119	NC_009621	CAT	2	6	6074	6079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150377176
120	NC_009621	TAC	2	6	6157	6162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_009621	CGC	2	6	6205	6210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_009621	GC	3	6	6231	6236	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_009621	TGA	2	6	6281	6286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009621	CT	3	6	6309	6314	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_009621	CCG	2	6	6315	6320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_009621	TCT	2	6	6325	6330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_009621	CA	3	6	6416	6421	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_009621	ACC	2	6	6422	6427	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_009621	ACT	2	6	6451	6456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_009621	CAC	2	6	6516	6521	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_009621	CAA	2	6	6579	6584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150377177
132	NC_009621	GAC	2	6	6658	6663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150377177
133	NC_009621	GGC	2	6	6700	6705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150377177
134	NC_009621	CGA	2	6	6711	6716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150377177
135	NC_009621	GGC	2	6	6754	6759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150377177
136	NC_009621	GGC	2	6	6781	6786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150377177
137	NC_009621	CGG	2	6	6807	6812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150377177
138	NC_009621	TCT	2	6	6827	6832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150377177
139	NC_009621	CAT	2	6	6852	6857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150377177
140	NC_009621	CGG	2	6	6861	6866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150377177
141	NC_009621	G	6	6	6888	6893	0 %	0 %	100 %	0 %	150377177
142	NC_009621	ACG	2	6	6902	6907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150377177
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150	NC_009621	GGC	2	6	7126	7131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150377177
151	NC_009621	CGA	2	6	7137	7142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150377177
152	NC_009621	CGG	2	6	7152	7157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150377177
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154	NC_009621	CGG	2	6	7179	7184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150377177
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163	NC_009621	CGGCG	2	10	7584	7593	0 %	0 %	60 %	40 %	150377177
164	NC_009621	CGA	2	6	7680	7685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150377177
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166	NC_009621	CGC	2	6	7756	7761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
167	NC_009621	GCG	2	6	7775	7780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
168	NC_009621	CGA	2	6	7799	7804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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170	NC_009621	TCG	2	6	7926	7931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
171	NC_009621	GCA	3	9	7967	7975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150377178
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252	NC_009621	CGTCA	2	10	10850	10859	20 %	20 %	20 %	40 %	150377181
253	NC_009621	CGT	2	6	10865	10870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150377181
254	NC_009621	TCG	2	6	10875	10880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150377181
255	NC_009621	GCC	2	6	10940	10945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150377181
256	NC_009621	CCG	2	6	11014	11019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150377181
257	NC_009621	CGC	2	6	11030	11035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150377181
258	NC_009621	TCA	2	6	11092	11097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150377181
259	NC_009621	TGC	2	6	11162	11167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150377181
260	NC_009621	CGC	2	6	11215	11220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150377181
261	NC_009621	CTGC	2	8	11257	11264	0 %	25 %	25 %	50 %	150377181
262	NC_009621	GC	3	6	11364	11369	0 %	0 %	50 %	50 %	150377181
263	NC_009621	CACC	2	8	11421	11428	25 %	0 %	0 %	75 %	150377182
264	NC_009621	CCG	2	6	11431	11436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150377182
265	NC_009621	GGCGC	2	10	11437	11446	0 %	0 %	60 %	40 %	150377182
266	NC_009621	GC	4	8	11462	11469	0 %	0 %	50 %	50 %	150377182
267	NC_009621	GTC	2	6	11498	11503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150377182
268	NC_009621	ACG	2	6	11546	11551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150377182
269	NC_009621	CCA	2	6	11578	11583	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150377182
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271	NC_009621	CGA	2	6	11821	11826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150377182
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273	NC_009621	CGA	3	9	11916	11924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150377182
274	NC_009621	CGA	2	6	12021	12026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150377182
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281	NC_009621	GGC	3	9	12280	12288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150377182
282	NC_009621	GC	3	6	12324	12329	0 %	0 %	50 %	50 %	150377182
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293	NC_009621	CAT	2	6	12735	12740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150377183
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380	NC_009621	TCC	2	6	17151	17156	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	150377187
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385	NC_009621	ATC	2	6	17475	17480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150377187
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387	NC_009621	TGA	2	6	17527	17532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150377187
388	NC_009621	T	6	6	17554	17559	0 %	100 %	0 %	0 %	150377187
389	NC_009621	GATC	2	8	17611	17618	25 %	25 %	25 %	25 %	150377187
390	NC_009621	ACG	2	6	17637	17642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150377187
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392	NC_009621	CGG	2	6	17935	17940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150377187
393	NC_009621	GCGA	2	8	18082	18089	25 %	0 %	50 %	25 %	150377188
394	NC_009621	GCT	2	6	18293	18298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150377188
395	NC_009621	TCG	2	6	18346	18351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150377188
396	NC_009621	TGC	2	6	18409	18414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150377188
397	NC_009621	CGG	2	6	18512	18517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150377188
398	NC_009621	CGCA	2	8	18603	18610	25 %	0 %	25 %	50 %	150377188
399	NC_009621	CTC	2	6	18648	18653	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	150377188
400	NC_009621	CCGT	2	8	18654	18661	0 %	25 %	25 %	50 %	150377188
401	NC_009621	CGG	2	6	18692	18697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150377188
402	NC_009621	GCCGC	2	10	18723	18732	0 %	0 %	40 %	60 %	150377188
403	NC_009621	GCG	2	6	18741	18746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150377188
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407	NC_009621	CTC	2	6	18843	18848	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	150377188
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414	NC_009621	GCG	2	6	19197	19202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150377188
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424	NC_009621	AGGC	2	8	19430	19437	25 %	0 %	50 %	25 %	150377189
425	NC_009621	GGCA	2	8	19476	19483	25 %	0 %	50 %	25 %	150377189
426	NC_009621	CATC	2	8	19679	19686	25 %	25 %	0 %	50 %	150377190
427	NC_009621	CTC	2	6	19692	19697	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	150377190
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430	NC_009621	CTC	2	6	19953	19958	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	150377190
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433	NC_009621	CTT	2	6	20046	20051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150377190
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452	NC_009621	A	6	6	20893	20898	100 %	0 %	0 %	0 %	150377190
453	NC_009621	CGT	2	6	20949	20954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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455	NC_009621	TCGG	2	8	21034	21041	0 %	25 %	50 %	25 %	150377191
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482	NC_009621	CTT	2	6	22213	22218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150377192
483	NC_009621	CGGC	2	8	22246	22253	0 %	0 %	50 %	50 %	150377192
484	NC_009621	GCG	2	6	22288	22293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150377192
485	NC_009621	AAAC	2	8	22388	22395	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
486	NC_009621	T	6	6	22446	22451	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
487	NC_009621	GAA	2	6	22460	22465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
488	NC_009621	TC	3	6	22574	22579	0 %	50 %	0 %	50 %	150377193
489	NC_009621	TGG	2	6	22609	22614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150377193
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499	NC_009621	ATG	2	6	22987	22992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150377193
500	NC_009621	CG	3	6	23011	23016	0 %	0 %	50 %	50 %	150377193

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